ในซีซั่น 3 นี้ เหล่านินจาผู้รักการผจญภัยจะได้เรียนรู้คาตะใหม่ๆ พบกับเก็น ลูกพี่ลูกน้องของเวสลีย์ และไปเที่ยวโอซาก้า บ้านเกิดของบาจังที่ประเทศญี่ปุ่น