มหกรรมกีฬาโลกเริ่มต้นขึ้นพร้อมการเปิดตัวรถไฟความเร็วสูงใหม่ แต่แล้วเกิดเหตุลึกลับ เมื่อบุคคลสำคัญระดับสูงของงานได้ถูกลักพาตัวไปทีละคน โคนัน และ ชูอิจิ อากากิ จึงต้องไขคดีปริศนาที่เกิดขึ้น