หลังจากที่ไนน์ขโมยพาราด็อกซ์ปริซึมไปสร้างโลกตามใจปรารถนา โซนิคจึงต้องร่วมมือกับพันธมิตรต่างขั้วเพื่อนำความสงบสุขคืนสู่แชตเตอร์เวิร์ส